Des années après les événements de Getter Robo/Shin Getter Robo, Hayato Jin est le chef de NISAR ; une organisation privée de recherche et de développement d’armes basée au Japon. Lui et le professeur Tachibana ont développé diverses armes et renforcé leurs forces pour faire face à une menace apparue il y a quinze ans : le savant fou Rando. Lorsque les forces de Rando commencent leurs opérations terroristes à travers le monde, NISAR commence sa recherche de soldats exceptionnels pour piloter leur super arme, le Getter Robo.