Lorsque des chercheurs découvrent un fossile du Pokémon mythique Mew, ils créent une création qui va à l'encontre des lois mêmes de la nature : Mewtwo, un Pokémon légendaire destiné à être utilisé comme outil de destruction. Mais à mesure que Mewtwo prend conscience de son existence, il commence à en vouloir à ses créateurs humains et cherche à se venger. Sacha, Pikachu et leurs amis se retrouvent au centre de son déchaînement ! Alors que l’avenir du monde Pokémon est en jeu, nos héros seront-ils capables de relever le défi de Mewtwo… et Mewtwo pourra-t-il trouver un nouveau sens à sa vie ? (Source : Médias VIZ)